Uždegimas, smegenų, dažniausiai sukelia virusinės infekcijos. Encefalitas taip pat gali būti sukeltas bakterinė infekcija, toksinų arba autoimuninius procesą. Encefalitas intervalo švelnios, pvz., į gripą panašūs simptomai,-sunkus, pvz., konfiskavimo atvejų simptomai. Į žmones su ŽIV, encefalito gali būti ŽIV infekcijos arba oportunistines infekcijas, pvz., Toxoplasma gondii infekcijos.