Caractéristique des chordés, fentes pharyngeal ya des ouvertures à travers lequel l'eau est prélevée dans le pharynx ou gorge. Dans les chordés primitifs les fentes pharyngiennes servent à filtrer l'eau et filtrer les particules de nourriture ; chez les poissons, ils sont modifiés pour la respiration. La plupart des vertébrés terrestres ont des fentes pharyngiennes seulement au stade embryonnaire.